Skip to main content

Table 2 Correlation of relative miRNA expression obtained from HTS QRT-PCR or traditional QRT-PCR.

From: MicroRNA profile of polyunsaturated fatty acid treated glioma cells reveal apoptosis-specific expression changes

  miRNA-16 A D G T    miRNA-30c A D G T
GBM2 HTS QRT-PCR -0,2 -0,78 n.d. -3,78   GBM2 HTS QRT-PCR -2,78 -4,08 -2,4 -2,1
  QRT-PCR -1,02 -1,02 -0,5 -1,59    QRT-PCR -5,63 -1,86 -2,16 -1,44
  confirm n y   y    confirm y y y y
GBM5 HTS QRT-PCR n.d. 3,49 -0,75 -1,13   GBM5 HTS QRT-PCR -3,88 -4,8 n.d. -4,26
  QRT-PCR 0,1 0,87 -0,92 -3,32    QRT-PCR -5,84 -2,71 -2,69 -2,72
  confirm   y y y    confirm y y   y
U373 HTS QRT-PCR n.d. -0,02 -0,15 -3,78   U373 HTS QRT-PCR -2,49 n.d. -6,84 -10,13
  QRT-PCR -1,25 -1,35 -1,66 -1,2    QRT-PCR -4,88 -3,17 -4,78 -3,74
  confirm   n n y    confirm y   y y
  miRNA-20b A D G T    miRNA-143 A D G T
GBM2 HTS QRT-PCR 3,58 -0,4 n.d. -2,47   GBM2 HTS QRT-PCR -1,2 -1,5 2,61 -0,36
  QRT-PCR 1,18 -1,02 -0,11 -2,07    QRT-PCR -1,3 -5,38 -3,8 -2,44
  confirm y y   y    confirm y y n n
GBM5 HTS QRT-PCR 4,11 1,17 -0,6 0,85   GBM5 HTS QRT-PCR -1,76 -1,18 -1,77 -0,14
  QRT-PCR 3,81 4,34 4,02 2,31    QRT-PCR -3,8 -3 -3,62 -1,53
  confirm y y n y    confirm y y y n
U373 HTS QRT-PCR 0,72 2,62 -0,93 0,05   U373 HTS QRT-PCR 0,67 1,62 -0,04 -0,5
  QRT-PCR 2,37 1,18 0,41 0,63    QRT-PCR -1,98 0,05 1,25 -1,45
  confirm y y n y    confirm n n n y
  miRNA-22 A D G T    miRNA-145 A D G T
GBM2 HTS QRT-PCR 0,01 0,57 -3,53 -3,38   GBM2 HTS QRT-PCR -5,7 -7,35 -2,72 -0,77
  QRT-PCR -1,85 -0,87 -6,26 -2,16    QRT-PCR -8,5 -1,5 -1,45 -1,64
  confirm n n y y    confirm y y y y
GBM5 HTS QRT-PCR -1,08 -186 -2,07 -0,08   GBM5 HTS QRT-PCR -2,19 -2,35 0,01 n.d.
  QRT-PCR -2,15 -2,69 -3,18 -2,06    QRT-PCR -4,75 -4,74 -2,1 -20,71
  confirm y y y n    confirm y y n  
U373 HTS QRT-PCR -2,52 -1,21 0,45 0,08   U373 HTS QRT-PCR 0,61 2,56 0,59 0,53
  QRT-PCR -4,21 -4,1 -4,99 n.d.    QRT-PCR 1,61 1,54 0,5 1,47
  confirm y y n     confirm y y y y
  1. A: ALA; D: DHA; G: GLA; T: temozolomide
Back to article page

Lipids in Health and Disease

ISSN: 1476-511X