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Table 2 Correlation of relative miRNA expression obtained from HTS QRT-PCR or traditional QRT-PCR.

From: MicroRNA profile of polyunsaturated fatty acid treated glioma cells reveal apoptosis-specific expression changes

 

miRNA-16

A

D

G

T

  

miRNA-30c

A

D

G

T

GBM2

HTS QRT-PCR

-0,2

-0,78

n.d.

-3,78

 

GBM2

HTS QRT-PCR

-2,78

-4,08

-2,4

-2,1

 

QRT-PCR

-1,02

-1,02

-0,5

-1,59

  

QRT-PCR

-5,63

-1,86

-2,16

-1,44

 

confirm

n

y

 

y

  

confirm

y

y

y

y

GBM5

HTS QRT-PCR

n.d.

3,49

-0,75

-1,13

 

GBM5

HTS QRT-PCR

-3,88

-4,8

n.d.

-4,26

 

QRT-PCR

0,1

0,87

-0,92

-3,32

  

QRT-PCR

-5,84

-2,71

-2,69

-2,72

 

confirm

 

y

y

y

  

confirm

y

y

 

y

U373

HTS QRT-PCR

n.d.

-0,02

-0,15

-3,78

 

U373

HTS QRT-PCR

-2,49

n.d.

-6,84

-10,13

 

QRT-PCR

-1,25

-1,35

-1,66

-1,2

  

QRT-PCR

-4,88

-3,17

-4,78

-3,74

 

confirm

 

n

n

y

  

confirm

y

 

y

y

 

miRNA-20b

A

D

G

T

  

miRNA-143

A

D

G

T

GBM2

HTS QRT-PCR

3,58

-0,4

n.d.

-2,47

 

GBM2

HTS QRT-PCR

-1,2

-1,5

2,61

-0,36

 

QRT-PCR

1,18

-1,02

-0,11

-2,07

  

QRT-PCR

-1,3

-5,38

-3,8

-2,44

 

confirm

y

y

 

y

  

confirm

y

y

n

n

GBM5

HTS QRT-PCR

4,11

1,17

-0,6

0,85

 

GBM5

HTS QRT-PCR

-1,76

-1,18

-1,77

-0,14

 

QRT-PCR

3,81

4,34

4,02

2,31

  

QRT-PCR

-3,8

-3

-3,62

-1,53

 

confirm

y

y

n

y

  

confirm

y

y

y

n

U373

HTS QRT-PCR

0,72

2,62

-0,93

0,05

 

U373

HTS QRT-PCR

0,67

1,62

-0,04

-0,5

 

QRT-PCR

2,37

1,18

0,41

0,63

  

QRT-PCR

-1,98

0,05

1,25

-1,45

 

confirm

y

y

n

y

  

confirm

n

n

n

y

 

miRNA-22

A

D

G

T

  

miRNA-145

A

D

G

T

GBM2

HTS QRT-PCR

0,01

0,57

-3,53

-3,38

 

GBM2

HTS QRT-PCR

-5,7

-7,35

-2,72

-0,77

 

QRT-PCR

-1,85

-0,87

-6,26

-2,16

  

QRT-PCR

-8,5

-1,5

-1,45

-1,64

 

confirm

n

n

y

y

  

confirm

y

y

y

y

GBM5

HTS QRT-PCR

-1,08

-186

-2,07

-0,08

 

GBM5

HTS QRT-PCR

-2,19

-2,35

0,01

n.d.

 

QRT-PCR

-2,15

-2,69

-3,18

-2,06

  

QRT-PCR

-4,75

-4,74

-2,1

-20,71

 

confirm

y

y

y

n

  

confirm

y

y

n

 

U373

HTS QRT-PCR

-2,52

-1,21

0,45

0,08

 

U373

HTS QRT-PCR

0,61

2,56

0,59

0,53

 

QRT-PCR

-4,21

-4,1

-4,99

n.d.

  

QRT-PCR

1,61

1,54

0,5

1,47

 

confirm

y

y

n

   

confirm

y

y

y

y

  1. A: ALA; D: DHA; G: GLA; T: temozolomide