TY - JOUR AU - Ikeda-Ohtsubo, W. AU - Miyahara, M. AU - Kim, S. W. AU - Yamada, T. AU - Matsuoka, M. AU - Watanabe, A. AU - Fushinobu, S. AU - Wakagi, T. AU - Shoun, H. AU - Miyauchi, K. AU - Endo, G. PY - 2013 DA - 2013// TI - Bioaugmentation of a wastewater bioreactor system with the nitrous oxide-reducing denitrifier Pseudomonas stutzeri JO - J Biosci Bioeng VL - 115 UR - https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2012.08.015 DO - 10.1016/j.jbiosc.2012.08.015 ID - Ikeda-Ohtsubo2013 ER - TY - JOUR AU - Fendri, I. AU - Chaari, A. AU - Dhouib, A. AU - Jlassi, B. AU - Abousalham, A. AU - Carriere, F. AU - Sayadi, S. AU - Abdelkafi, S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Isolation, identification and characterization of a new lipolytic Pseudomonas sp., from Tunisian soil JO - Environ Technol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1080/09593330903369994 DO - 10.1080/09593330903369994 ID - Fendri2010 ER - TY - JOUR AU - Fendri, I. AU - Bouaziz, M. AU - Labat, M. AU - Sayadi, S. AU - Abdelkafi, S. PY - 2013 DA - 2013// TI - Olive fermentation wastewater: the valorisation methods JO - Environ Technol VL - 34 UR - https://doi.org/10.1080/09593330.2012.689364 DO - 10.1080/09593330.2012.689364 ID - Fendri2013 ER - TY - JOUR AU - Dabboussi, F. AU - Hamze, M. AU - Singer, E. R. AU - Geoffroy, V. AU - Meyer, J. M. AU - Izard, D. PY - 2002 DA - 2002// TI - Pseudomonas mosselii sp. nov., a novel species isolated from clinical specimens JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 52 UR - https://doi.org/10.1099/00207713-52-2-363 DO - 10.1099/00207713-52-2-363 ID - Dabboussi2002 ER - TY - JOUR AU - Liu, N. AU - Jiang, J. L. AU - Cai, L. L. AU - Li, W. PY - 2011 DA - 2011// TI - Characterization and optimization of Fe(II)Cit-NO reduction by Pseudomonas sp JO - Environ Technol VL - 32 UR - https://doi.org/10.1080/09593330.2011.559277 DO - 10.1080/09593330.2011.559277 ID - Liu2011 ER - TY - JOUR AU - Liu, J. AU - Zhang, Z. AU - Zhu, H. AU - Dang, H. AU - Lu, J. AU - Cui, Z. PY - 2011 DA - 2011// TI - Isolation and characterization of α-amylase from marine Pseudomonas sp, K6-28-040 JO - Afr J Biotechnol VL - 10 UR - https://doi.org/10.5897/AJB11.1987 DO - 10.5897/AJB11.1987 ID - Liu2011 ER - TY - JOUR AU - Khemakhem, B. AU - Fendri, I. AU - Dahech, I. AU - Belghuith, K. AU - Kammoun, R. AU - Mejdoub, H. PY - 2013 DA - 2013// TI - Purification and characterization of a maltogenic amylase from Fenugreek (Trigonella foenum graecum) seeds using the Box Behnken Design (BBD) JO - Ind Crops Prod VL - 43 UR - https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2012.07.019 DO - 10.1016/j.indcrop.2012.07.019 ID - Khemakhem2013 ER - TY - JOUR AU - Ueda, M. AU - Asano, T. AU - Nakazawa, M. AU - Miyatake, K. AU - Inouye, K. PY - 2008 DA - 2008// TI - Purification and characterization of novel raw-starch-digesting and cold-adapted α-amylases from Eisenia foetida JO - Comp Biochem Phys VL - 150 UR - https://doi.org/10.1016/j.cbpb.2008.02.003 DO - 10.1016/j.cbpb.2008.02.003 ID - Ueda2008 ER - TY - JOUR AU - Fendri, I. AU - Ben Saad, R. AU - Khemakhem, B. AU - Ben Halima, N. AU - Gdoura, R. AU - Abdelkafi, S. PY - 2013 DA - 2013// TI - Effect of treated and untreated domestic wastewater on seed germination, seedling growth and amylase and lipase activities in Avena sativa L JO - J Sci Food Agric VL - 93 UR - https://doi.org/10.1002/jsfa.5923 DO - 10.1002/jsfa.5923 ID - Fendri2013 ER - TY - JOUR AU - Pandey, A. AU - Nigam, P. AU - Soccol, C. R. AU - Soccol, V. T. AU - Singh, D. AU - Mohan, R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Advances in microbial amylases JO - Biotechnol Appl Biochem VL - 31 UR - https://doi.org/10.1042/BA19990073 DO - 10.1042/BA19990073 ID - Pandey2000 ER - TY - JOUR AU - Wang, J. AU - Wan, W. PY - 2009 DA - 2009// TI - Experimental design methods for fermentative hydrogen production: a review JO - Int J Hydrogen Energy VL - 34 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijhydene.2008.10.008 DO - 10.1016/j.ijhydene.2008.10.008 ID - Wang2009 ER - TY - BOOK AU - Myer, R. H. AU - Montogomery, D. C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Response surface methodology: process and product optimization using designed experiment PB - John Wiley and Sons CY - New York ID - Myer2002 ER - TY - JOUR AU - Bae, S. AU - Shoda, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Statistical optimization of culture conditions for bacterial cellulose production using Box Behnken design JO - Biotechnol Bioeng VL - 90 UR - https://doi.org/10.1002/bit.20325 DO - 10.1002/bit.20325 ID - Bae2005 ER - TY - CHAP AU - Ray, S. AU - Reaume, S. J. AU - Lalman, J. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Developing a statistical model to predict hydrogen production by a mixed anaerobic mesophilic culture BT - Int J Hydrogen Energy ID - Ray2010 ER - TY - JOUR AU - Abdelkafi, S. AU - Labat, M. AU - Ben Ali Gam, Z. AU - Lorquin, J. AU - Casalot, L. AU - Sayadi, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Optimized conditions for the synthesis of vanillic acid under hypersaline conditions by Halomonas elongata DSM 2581T resting cells JO - World J Microbiol Biotechnol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1007/s11274-007-9523-3 DO - 10.1007/s11274-007-9523-3 ID - Abdelkafi2008 ER - TY - JOUR AU - Abdelkafi, S. AU - Chamkha, M. AU - Casalot, L. AU - Sayadi, S. AU - Labat, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Isolation and characterization of a novel Bacillus sp., strain YAS1, capable of transforming tyrosol under hypersaline conditions JO - FEMS Microbiol Lett VL - 252 UR - https://doi.org/10.1016/j.femsle.2005.08.032 DO - 10.1016/j.femsle.2005.08.032 ID - Abdelkafi2005 ER - TY - JOUR AU - Abdelkafi, S. AU - Labat, M. AU - Casalot, L. AU - Chamkha, M. AU - Sayadi, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Isolation and characterization of Halomonas sp. strain IMPC, a p-coumaric acid-metabolising bacterium that decarboxylates other cinnamic acids under hypersaline conditions JO - FEMS Microbiol Lett VL - 255 UR - https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2005.00061.x DO - 10.1111/j.1574-6968.2005.00061.x ID - Abdelkafi2006 ER - TY - JOUR AU - Ben Ali Gam, Z. AU - Abdelkafi, S. AU - Casalot, L. AU - Tholozan, J. L. AU - Oueslati, R. AU - Labat, M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Modicisalibacter tunisiensis gen. nov., sp. nov., an aerobic, moderately halophilic bacterium isolated from an oilfield-water injection sample, and emended description of the family Halomonadaceae JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 57 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.65088-0 DO - 10.1099/ijs.0.65088-0 ID - Ben Ali Gam2007 ER - TY - JOUR AU - Ben Ali Gam, Z. AU - Oueslati, R. AU - Abdelkafi, S. AU - Casalot, L. AU - Tholozan, J. L. AU - Labat, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Desulfovibrio tunisiensis sp. nov., a novel weakly halotolerant, sulfate-reducing bacterium isolated from exhaust water of a Tunisian oil refinery JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 59 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.000943-0 DO - 10.1099/ijs.0.000943-0 ID - Ben Ali Gam2009 ER - TY - JOUR AU - Logan, N. A. AU - Berkeley, R. C. W. PY - 1984 DA - 1984// TI - Identification of Bacillus strains using the API system JO - J Gen Microbiol VL - 130 ID - Logan1984 ER - TY - JOUR AU - Winker, S. AU - Woese, C. R. PY - 1991 DA - 1991// TI - A definition of the domains Archea, Bacteria and Eucarya in terms of small subunit ribosomal rRNA characteristics JO - Syst Appl Microbiol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1111/j.1472-765X.1991.tb00597.x DO - 10.1111/j.1472-765X.1991.tb00597.x ID - Winker1991 ER - TY - JOUR AU - Hall, T. A. PY - 1999 DA - 1999// TI - BioEdit: a user-friendly biological sequence alignement editor and analysis program for windows 95/98 NT JO - Nucleic Acids Sym Ser VL - 41 ID - Hall1999 ER - TY - JOUR AU - Maidak, B. L. AU - Cole, J. R. AU - Lilbrum, T. G. AU - Parker, C. T. AU - Saxman, P. R. AU - Farris, R. J. AU - Garrity, G. M. AU - Olsen, G. J. AU - Schmidt, T. M. AU - Tiedje, J. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - The RDP-II (Ribosomal Database Project) JO - Nucleic Acids Res VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/nar/29.1.173 DO - 10.1093/nar/29.1.173 ID - Maidak2001 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Madden, T. L. AU - Schäffer, A. A. AU - Zhang, Z. AU - Miller, W. AU - Lipman, D. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Gapped Blast and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389 DO - 10.1093/nar/25.17.3389 ID - Altschul1997 ER - TY - JOUR AU - Benson, D. A. AU - Boguski, M. S. AU - Lipman, D. J. AU - Oullette, B. F. F. AU - Rapp, B. A. AU - Wheeler, D. L. PY - 1999 DA - 1999// TI - GenBank JO - Nucleic Acids Res VL - 27 UR - https://doi.org/10.1093/nar/27.1.12 DO - 10.1093/nar/27.1.12 ID - Benson1999 ER - TY - CHAP AU - Jukes, T. H. AU - Cantor, C. R. ED - Munro, H. N. PY - 1969 DA - 1969// TI - Evolution of protein molecules BT - Mammalian Protein Metabolism PB - Academic Press CY - New York ID - Jukes1969 ER - TY - JOUR AU - Saitou, N. AU - Nei, M. PY - 1987 DA - 1987// TI - The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees JO - Mol Biol Evol VL - 4 ID - Saitou1987 ER - TY - JOUR AU - Felsenstein, J. PY - 1985 DA - 1985// TI - Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap JO - Evolution VL - 39 UR - https://doi.org/10.2307/2408678 DO - 10.2307/2408678 ID - Felsenstein1985 ER - TY - JOUR AU - Abdelkafi, S. AU - Ogata, H. AU - Barouh, N. AU - Fouquet, B. AU - Lebrun, R. AU - Pina, M. AU - Scheirlinckx, F. AU - Villeneuve, P. AU - Carriere, F. PY - 2009 DA - 2009// TI - Identification and biochemical characterization of a GDSL-motif carboxylester hydrolase from Carica papaya latex JO - Biochim Biophys Acta VL - 1791 UR - https://doi.org/10.1016/j.bbalip.2009.06.006 DO - 10.1016/j.bbalip.2009.06.006 ID - Abdelkafi2009 ER - TY - JOUR AU - Barouh, N. AU - Abdelkafi, S. AU - Fouquet, B. AU - Pina, M. AU - Scheirlinckx, F. AU - Carrière, F. AU - Villeneuve, P. PY - 2010 DA - 2010// TI - Neutral lipid characterization of non-water-soluble fractions of Carica Papaya latex JO - J Am Oil Chem Soc VL - 87 UR - https://doi.org/10.1007/s11746-010-1582-1 DO - 10.1007/s11746-010-1582-1 ID - Barouh2010 ER - TY - JOUR AU - Abdelkafi, S. AU - Barouh, N. AU - Fouquet, B. AU - Fendri, I. AU - Pina, M. AU - Scheirlinckx, F. AU - Villeneuve, P. AU - Carriere, F. PY - 2011 DA - 2011// TI - Further biochemical characterization of the lipase activity in Carica papaya latex JO - Plant Foods Hum Nutr VL - 66 UR - https://doi.org/10.1007/s11130-010-0206-0 DO - 10.1007/s11130-010-0206-0 ID - Abdelkafi2011 ER - TY - JOUR AU - Miller, G. L. PY - 1959 DA - 1959// TI - Use of dinitrosalicylic acid reagent for determination of reducing sugars JO - Anal Chem VL - 31 UR - https://doi.org/10.1021/ac60147a030 DO - 10.1021/ac60147a030 ID - Miller1959 ER - TY - BOOK AU - Mathieu, D. AU - Nony, J. AU - Phan-Than-Luu, R. PY - 2000 DA - 2000// TI - NEMROD-W Software PB - LPRAI CY - Marseille ID - Mathieu2000 ER - TY - JOUR AU - Lai, Q. L. AU - Shao, Z. Z. PY - 2008 DA - 2008// TI - Pseudomonas xiamenensis sp nov., a denitrifying bacterium isolated from activated sludge JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 58 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.65459-0 DO - 10.1099/ijs.0.65459-0 ID - Lai2008 ER - TY - JOUR AU - Kato, J. AU - Kim, H. E. AU - Takiguchi, N. AU - Kuroda, A. AU - Ohtake, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Pseudomonas aeruginosa as a model microorganism for investigation of chemotactic behaviors in ecosystem JO - J Biosci Bioeng VL - 106 UR - https://doi.org/10.1263/jbb.106.1 DO - 10.1263/jbb.106.1 ID - Kato2008 ER - TY - JOUR AU - Verhille, S. AU - Baïda, N. AU - Dabboussi, F. AU - Hamze, M. AU - Izard, D. AU - Leclerc, H. PY - 1999 DA - 1999// TI - Pseudomonas gessardii sp. nov. and Pseudomonas migulae sp. nov., two new species isolated from natural mineral waters JO - Int J Syst Bacteriol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1099/00207713-49-4-1559 DO - 10.1099/00207713-49-4-1559 ID - Verhille1999 ER - TY - JOUR AU - Vela, A. I. AU - Gutiérrez, M. C. AU - Falsen, E. AU - Rollán, E. AU - Simarro, I. AU - García, P. AU - Domínguez, L. AU - Ventosa, A. AU - Fernández-Garayzábal, J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Pseudomonas simiae sp. nov., isolated from clinical specimens from monkeys (Callithrix geoffroyi) JO - Int J Syst Evol Microbiol VL - 56 UR - https://doi.org/10.1099/ijs.0.64378-0 DO - 10.1099/ijs.0.64378-0 ID - Vela2006 ER - TY - JOUR AU - Lee, S. Y. AU - Rhee, J. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Hydrolysis of triglyceride by the whole cell of Pseudomonas putida 3SK in two-phase batch and continuous reactors systems JO - Biotechnol Bioeng VL - 44 UR - https://doi.org/10.1002/bit.260440406 DO - 10.1002/bit.260440406 ID - Lee2008 ER - TY - JOUR AU - Yang, J. AU - Zhang, B. AU - Yan, Y. PY - 2009 DA - 2009// TI - Cloning and expression of Pseudomonas fluorescens 26–2 lipase gene in Pichia pastoris and characterizing for transestérification JO - Appl Biochem Biotechnol VL - 159 ID - Yang2009 ER - TY - JOUR AU - Petrova, P. AU - Emanuilova, M. AU - Petrov, K. PY - 2010 DA - 2010// TI - Amylolytic Lactobacillus strains from Bulgarian fermented beverage boza JO - Z Naturforsch C VL - 65 UR - https://doi.org/10.1515/znc-2010-3-409 DO - 10.1515/znc-2010-3-409 ID - Petrova2010 ER -