Skip to main content

Table 7 Haplotype analysis in patients with CAD and in control subjects

From: Relationship between CYP17A1 genetic polymorphism and coronary artery disease in a Chinese Han population

Haplotype No. 1 No. 2 No. 3 No. 4 Overall P value Frequency in total Frequency in man Frequency in woman
Total Man Woman CAD Control P value CAD Control P value CAD Control P value
   SNP3   SNP5 0.877 0.340 0.105          
H1   A   T     0.217 0.206 0.617 0.188 0.222 0.190 0.249 0.189 0.041
H2   G   C     0.183 0.182 0.985 0.188 0.196 0.754 0.170 0.167 0.951
H3   G   T     0.591 0.597 0.686 0.609 0.570 0.182 0.573 0.627 0.074
    SNP4 SNP5 0.399 0.099 0.964          
H1    C C     0.192 0.186 0.793 0.201 0.195 0.857 0.180 0.177 0.985
H2    C T     0.294 0.268 0.235 0.299 0.241 0.047 0.288 0.296 0.787
H3    T T     0.509 0.535 0.201 0.494 0.550 0.055 0.528 0.520 0.854
  SNP1 SNP3 SNP4   0.612 0.167 0.155          
H1 A A T      0.094 0.094 0.981 0.070 0.104 0.053 0.127 0.082 0.034
H2 A G C      0.471 0.446 0.280 0.487 0.436 0.102 0.449 0.456 0.834
H3 A G T      0.299 0.327 0.192 0.307 0.324 0.552 0.290 0.331 0.189
  SNP1 SNP3   SNP5 0.961 0.225 0.154          
H1 A A   T     0.098 0.096 0.933 0.067 0.103 0.040 0.135 0.088 0.035
H2 A G   C     0.186 0.181 0.795 0.192 0.194 0.972 0.173 0.167 0.853
H3 C A   T     0.116 0.109 0.701 0.119 0.117 0.893 0.110 0.102 0.742
  SNP1   SNP4 SNP5 0.415 0.117 0.986          
H1 A   C T     0.295 0.268 0.225 0.302 0.242 0.040 0.286 0.296 0.733
H2 A   T T     0.385 0.419 0.104 0.364 0.427 0.031 0.415 0.411 0.953
H3 C   T T     0.122 0.115 0.668 0.127 0.121 0.830 0.114 0.109 0.830
   SNP3 SNP4 SNP5 0.463 0.211 0.282          
H1   A T T     0.211 0.205 0.776 0.190 0.221 0.219 0.239 0.187 0.071
H2   G C C     0.180 0.177 0.905 0.190 0.189 0.968 0.165 0.164 0.976
H3   G C T     0.291 0.266 0.239 0.297 0.241 0.048 0.284 0.292 0.761
  SNP1 SNP3 SNP4 SNP5 0.577 0.098 0.302          
H1 A A T T     0.092 0.094 0.878 0.066 0.103 0.033 0.127 0.084 0.045
H2 A G C C     0.181 0.177 0.851 0.191 0.189 0.949 0.169 0.165 0.913
H3 A G C T     0.292 0.226 0.221 0.300 0.243 0.039 0.280 0.290 0.693
H4 A G T T     0.294 0.326 0.124 0.297 0.324 0.360 0.291 0.329 0.213
H5 C A T T     0.117 0.110 0.673 0.121 0.116 0.817 0.110 0.103 0.753
  1. CAD, Coronary artery disease; haplotype with frequencies >0.03 were estimated using SHEsis software; P value was calculated by permutation test using the bootstrap method; SNP, single-nucleotide polymorphism.